У нас было так: раньше в аспирантуру выпускникам текущего года нужна была рекомендация Учёного совета и совет мог ограничивать принципы выдачи рекомендации (у нас, например, давали без троек или с одной тройкой не по специальности). С тех пор, как аспирантура стала третьим уровнем образования, рекомендации перестали учитываться, так что теперь поступление в аспирантуру происходит по конкурсу на основании вступительных испытаний.